本申请涉及一种顶管下穿既有水道人工清障施工方法，其包括：S1、按预设顶进路线进行管道铺设；S2、判断顶进路线是否存在障碍物，获取障碍物位置并规划反向清障路线；S3、反向补打超前探孔并判断反向清障道路是否存在障碍物；S4、从接收井铺设混凝土套管反向顶进至障碍物位置并套接于顶进管道，混凝土套管之间通过承接组件进行套接；S5、在混凝土套管中进行反向掏挖至障碍物位置；S6、对障碍物进行人工清障处理，反向将障碍物从接收井清除；S7、按照预设顶进路线继续进行管道铺设，将机头导引至接收井位置；S8、对混凝土套管和顶进管道之间的缝隙进行注浆填充处理。本申请具有降低清障施工成本、提高顶管下穿既有水道的清障便利性的效果。