本发明所述的一种制备黄皮果醋的方法，包括以下步骤：步骤1：制备黄皮汁，并将制备好的黄皮汁于低于‑18℃条件下保存备用；步骤2：添加用于酒精发酵的干酵母于黄皮汁中，进行酒精发酵；步骤3：将活化后的醋酸菌接种至上述黄皮汁中进行醋酸发酵，待醋酸菌将乙醇转化为乙酸，乙酸不再变化时，发酵完成即制得黄皮果醋；其中，醋酸发酵的时间为6‑10天，醋酸菌接种量为0.2‑0.4g/L，发酵温度为25‑45℃。本发明以单一黄皮果汁为原料，最大化地保留了黄皮独特的风味，综合考虑发酵时间、温度，尤其是选择醋酸接种量为0.2‑0.4g/L，对果醋总酸含量的影响最大，果醋中能够达到总酸含量6.82g/100mL。本发明制备的黄皮果醋酸味十足，口感尚佳，适合普遍推广与生产。