本发明提供一种高导热低密度双组份聚氨酯结构胶及其制备方法，可用于动力电池结构粘接。本发明双组份聚氨酯结构胶通过筛选特定种类和配比的聚酯多元醇、聚醚多元醇、催化剂、无机填料、分子筛制成A组分，特定种类和配比的氢化二苯甲烷二异氰酸酯、聚醚多元醇、除水剂、无机填料、硅烷偶联剂制成B组分，两者按照1:1体积比复配使用，对于不做处理的3003铝材之间的粘接破坏形式可以达到内聚破坏，剪切强度≥8MPa，固化物导热系数达2.0W/(m.K)以上，同时各密度≤2.2g/mL，可借助双组份胶枪施胶，具备良好的可操作性能。