本发明公开了一种基于机载动态伴随的反无人机系统及方法，该方法包括：空中平台接收空情通告，开启常规机载探测雷达对空域进行搜索与预警；指挥控制子系统指挥雷达探识子系统、光电探识子系统以及电子侦测子系统对任务空域的无人机进行搜索与预警；通过数据融合形成目标的点迹航迹，形成空域的目标态势；对无人机目标进行威胁判定，同时给出威胁处置决策；根据指示的信息进行相应的电子干扰或者摧毁，指挥控制子系统调度反无探识雷达、光电探识雷达以及电子侦测设备对处置区域进行再次感知，并开展毁伤评估，给出是否需要再次处置的决策；根据决策的结果，判断是否结束。本发明有效满足应对多样化无人机威胁场景下的反无人机作战任务的需要。