本发明属于煤矿开采技术领域，具体涉及一种小窑破坏区煤层充填复采方法。步骤为：S1)确定充填复采区小窑空棚空巷分布情况，且将充填复采区划分为实体煤区、顶板未垮落区、顶板部分垮落区、顶板充分垮落区；S2)分析黄土的侧限压缩特性；S3)向黄土中掺入预设比例的石灰，以该变黄土的塑限、液限及塑性指数；S4)确定充填关键层临界厚度；S4)制作填料：将黄土和预设比例的石灰通过制浆机制浆形成浆液，然后将浆液经由注浆泵与注浆管路分别送至顶板未垮落区、顶板部分垮落区、顶板充分垮落区进行分别填充，以形成预设厚度以上的充填关键层。本发明能确保工作面安全通过小窑采空区。