本发明公开了一种基于微孔膜反应器装置制备1,3‑二油酸‑2‑棕榈酸甘油三酯的方法及装置，通过化学法对棕榈油进行改性提高sn‑2位棕榈酸含量；改性后的棕榈油与油酸分别通过进料泵泵入微孔膜反应器装置中的混合器，在混合器中混合均匀后，泵入装有1,3特异性脂肪酶的反应器中进行酸解反应；反应器内通过微孔膜将反应器内部分成反应侧和渗透侧，在反应过程中通过向反应侧加压，使得生成的水透过微孔膜从产物中除去，从而促进反应的正向进行；反应结束后通过反应器上的出料口将反应液体排出，收集即得。