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近日,中国科学院上海药物研究所的陆晓杰团队与郑明月团队合作在《Journal of Medicinal Chemistry》期刊上发表了一篇题为“通过化学空间互补的DEL筛选策略提升机器学习模型预测能力”的研究文章。该研究结合亲和力筛选和光交联筛选,旨在提高DEL化合物库的化学多样性,并通过与人工智能(AI)的结合,推动药物发现进程。
DEL技术由于具备高通量、操作简便、成本低等优势,已经成为发现创新抑制剂的理想工具。然而,它也面临着如假阳性信号难以消除和高质量化合物库需求等挑战。近年来,人工智能的迅猛发展为药物发现领域带来了新机遇,与DEL技术的结合使其在药物研发中更具潜力。
传统的亲和力筛选可识别高亲和力分子,而光交联筛选能够发现中等亲和力的小分子,这使得两者在筛选过程中能够互为补充。光交联筛选仅需一轮洗脱,因而信号强度不如亲和力筛选高,这给数据分析带来了困难。不过,将这两种方法结合可以更全面地解析靶点结合信息。
本研究综合了AIgn_promotion=LS_SEOGW">BRD4、AIgn_promotion=LS_SEOGW">p300和AIgn_promotion=LS_SEOGW">WDR5三种蛋白的DEL数据,从化学空间互补性、模型训练选择等多方面展开研究,最终成功构建了针对特定蛋白的小分子预测模型,并发现了具有开发潜力的先导化合物。这一成果为探索未充分研究的靶标药物提供了有效路径。
此研究为药物化学优化提供了新思路,使得通过DEL筛选发现的化合物在难以优化时,仍能继续开发为潜在的药物候选者。在AI技术的助力下,DEL技术将能够生产高质量和一致性的数据,尤其是在未完全探索的靶标领域,开启药物发现的新篇章。
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