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药物发现是一项复杂而精密的科学任务,在设计候选药物时需要遵循一系列指导原则。诸如Lipinski的“五规则”(Ro5)和Veber的“二规则”等经典规律,对新药研发起到了至关重要的指导作用。然而,随着科研的深入,对超出Ro5规则(bRo5)化学空间的研究逐渐增多,我们意识到须超越传统Ro5界限,方能发现具有新作用机制的药物。
目前,基于最新的口服PROTACs设计指导原则研究进展,本篇新闻稿总结了一系列药物设计指导原则,旨在为药物研发提供科学依据和方向指引。
1. Lipinski “五规则”
在20世纪90年代,药企积累了丰富的药物研发数据,这使得分析和识别影响药物口服吸收的关键因素成为可能。Lipinski和团队分析了大量已上市的口服药物,发现它们在分子量、脂溶性、氢键形成能力等方面存在共同特性。基于此,他们于1997年提出了Lipinski“五规则”(Ro5),用于预测小分子药物的口服生物利用度。具体指南如下:
- 分子量MW ≤ 500 Da
- 氢键供体HBD ≤ 5
- 氢键受体HBA ≤ 10
- 脂水分配系数MlogP ≤ 5
由于其简洁和实用性,Ro5迅速被药物化学界广泛接受,成为药物筛选和设计的重要工具。
2. Veber “二规则”
随着药物研发的深入,研究者意识到除了Lipinski五规则,还需其他参数来更全面地评估药物分子的吸收和分布特性。Veber等人认识到分子的极性表面积对药物跨膜运输能力有重要影响,特别在预测肠道吸收和血脑屏障穿透性方面尤为明显。通过对1100种候选药物的分析,Veber提出了“二规则”:
- 可旋转键数RB ≤ 10
- 极性表面积PSA ≤ 140 Ų;或氢键数HBA&HBD ≤ 12
Veber“二规则”因其有效性迅速被药物化学界广泛接受,并用于药物设计和筛选中,和Lipinski的五规则相辅相成,形成了更全面的预测标准。
3. bRo5“规则”
在药物化学中,随着分子设计和合成技术的发展,化学家能够创造出结构复杂、功能多样的分子,如单克隆抗体、肽类、核酸类药物、PROTACs等,这些药物的物理化学特性与传统小分子药物大相径庭。为更好地指导这些新型药物的发现和设计,研究人员提出了bRo5的概念,即超越Ro5规则的化学空间。通过对大量药物的物理化学性质和生物活性数据进行分析,研究发现了一些在bRo5空间内具有良好生物活性和成药性的分子特征:
- 脂水分配系数clogP 0 ≤ clogP ≤ 3
- 氢键供体HBD 2-3
- 拓扑极性表面积TPSA 0.2-0.25 × MW
- 可旋转键数NRotB 5-20
- AbbVie多参数方程: AB-MPS = Abs(clogP - 3) + NAR + NRoB < 15
bRo5规则的发现和完善仍在进行中,不断为新药的研发提供指导。
4. 口服PROTACs“规则”
蛋白质降解靶向嵌合体(PROTACs)是一种新兴药物模式,目前处于临床试验阶段。这些550至1600 Da的合成小分子通过结合目标蛋白和E3泛素连接酶,促进细胞内目标蛋白的降解。然而,关于它们在高等动物和人类中的吸收和分布特性研究较为匮乏。开创性的统计分析发现,在口服剂量高达30 mg/kg的1806种PROTACs中,只有15%具有25%的口服生物利用度。
为了研究PROTACs的关键物化特性对其口服生物利用度的影响,阿斯利康的研究人员报告了四种临床口服PROTACs(ARV-766、ARV-110、KT-474、ARV-471)在动物中的药代动力学特性,并总结出一个实验性的“口服PROTACs规则”:
- eHDB ≤ 2, eHBA ≤ 16
- ePSA ≤ 170
- eRotB ≤ 13
- MW ≤ 1000
- chromLogD ≤ 7
这项研究提出的“口服PROTACs规则”对改进PROTACs的口服生物利用度具有重要意义,并提供了新的设计指南。
5. 小 结
药物设计指导原则是药物研发的关键工具,确保新药研发的效率、安全性和有效性。这些规则和原则在不同研发阶段和药物类型中发挥作用,与Ro5相结合,为药物研发提供更全面的科学依据。
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