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β-Catenin致癌转录因子的共价降解剂

新药情报编辑 | 2024-08-08 |

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加州大学伯克利分校的Daniel Nomura教授团队发现了一种直接与CTNNB1结合并通过蛋白酶体系统进行降解的化合物NF764β-连环蛋白(CTNNB1, β-Catenin)是许多癌症(如肝癌肺癌结直肠癌乳腺癌卵巢癌)的驱动因子,其作为一种致癌转录因子,调节细胞间粘附,并在Wnt信号通路中起关键作用。CTNNB1突变常出现在其N端,阻止其泛素化和降解,从而增强其致癌活性。因此,针对CTNNB1的癌症治疗非常重要。

在研究中,作者在HEK293细胞中利用2100个半胱氨酸反应性共价配体文库筛选CTNNB1降解物。通过蛋白质组学技术,团队确定了EN83这一表现出剂量响应性的化合物,并在蛋白酶体抑制剂存在下显著减轻其CTNNB1降解效果。通过Western blotting技术验证,EN83在细胞中通过泛素-蛋白酶体介导的机制抑制CTNNB1转录活性,并且这一抑制作用显著高于其降解效果。

进一步实验表明,EN83能够直接与CTNNB1共价结合,靶向CTNNB1多个半胱氨酸位点,包括C439C466C520C619。其中,与C619的作用尤为显著。为了进一步验证EN83的作用机制,作者还合成了NF686类似物进行实验,证明了共价结合是CTNNB1降解的必要条件。

接下来,团队研究了EN83在体内的共价结合情况。通过质谱-基于探针的方法,团队发现EN83主要通过C619作用于CTNNB1,并且可能不涉及其他三种半胱氨酸位点。进一步优化实验显示,EN83的替代物NF764显现出更高的效力和选择性。研究表明NF764可以有效降解CTNNB1,尤其是在HT29结直肠癌细胞系中,并显著下调多个CTNNB1靶基因的mRNA水平。

为了验证NF764通过C619CTNNB1的结合,团队进行了突变实验。结果显示,C466SC520SC619S突变显著减弱了CTNNB1的降解,表明这三种半胱氨酸是CTNNB1降解的主要靶点。此外,NF764考察的细胞热变性实验进一步证实了CTNNB1NF764处理后出现明显的热不稳定性,支持了CTNNB1降解是通过直接共价结合诱导热稳定性改变来实现的。

总结而言,作者通过研究发现一种有效的CTNNB1降解剂NF764,该化合物通过直接共价靶向C619破坏并降解CTNNB1。与之前的CTNNB1抑制剂不同,NF764通过独特的机制实现对CTNNB1的高效和选择性降解,为未来癌症治疗提供了新的可能性。


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